保存型與去活化型病毒檢體運送培養基的效能評估

病毒檢體運送培養基(transport media)的主要功能是保存檢體中病原體的活性、抗原及核酸 其可避免檢體在運送過程中受到汙染。由於新冠病毒(SARS-CoV-2)肺炎疫情(COVID-19)的爆發 其診斷係以拭子(swab)採集呼吸道檢體進行分子檢測及/或養殖細胞接種。啟新生物科技有限公司於 2020 年上市兩種通用型病毒檢體運送培養裝置 一為保存型CMPTM viral transport medium w/oropharyngeal and/or nasopharyngeal flocked swab (VTM) 可 P2+ 或 P3 等級檢驗室分 病毒及進行分子檢測 一為去活化型 CMPTM inactivated viral transport medium w/oropharyngeal and/or nasopharyngeal flocked swab (I-VTM) 僅可檢驗室進行病毒之分子檢測。為了驗證此兩種病毒檢體運送培養基的效能 吾等根據 CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) 之 病 毒 運 送 之 M40-A2 (2014) SARS-CoV-2 同 RNA 病毒的腸病毒 71 型(Enteroviruses 71, EV 71)進行效能評估。測試時分別將 103 PFU (plaque forming unit)病毒量接種至 VTM 或 I-VTM 中 並模擬病毒檢體的運送及保存條件 分別將兩種裝置的運送培養基置於4C、-80C及室溫 並分別貯存不同的指定時間點(在 4C保存 6、24、48、72 及 96 小時 而在-80C及室溫保存 48、72 及 96 小時。此外 I-VTM 在各測試溫度額外保存 10 分鐘、30 分鐘、1、2、3 及 4 小時)後將VTM 或I-VTM 的EV 71 分別 種於 細胞(human rhabdomyosarcoma cell line, RD cell) 中 接 在 5% CO2 培養 中 培養 48-72 小時後 RD cell 的細胞病 效應(cytopathic effects, CPE)以及利用反轉錄-即時聚合酶鏈反應(quantitative reverse transcription PCR, qRT-PCR)偵測EV 71 核酸 (RNA)。本研究亦利用 SARS-CoV-2 檢測所用的三對基因片段 (E gene、RdRp gene 及 N gene) 以如同 EV 71 在VTM/I-VTM 的測試條件下進行測試 結果顯示 (i) VTM 在 4C、-80C及室溫的貯存指定時間點皆能完整保存 EV 71 之活性 而在RD cell 產生 CPE (ii) I-VTM 在 EV 71 接觸 2 小時後可將 106 PFU 的病毒完全裂解而將病毒去活化 (滅活) (iii) VTM 及 I-VTM 在各種測試條件下皆能保存 EV 71 核酸及 SARS- CoV-2 之核酸而分別可被qRT-PCR 方法檢出。基於上述的發現 吾等認為VTM 及I-VTM 適合用於病毒檢體的運送 個別檢驗室可根據病毒的檢驗方法、檢驗室設施的安全等級、檢驗標的病毒的風險等級(risk group)等 擇保存型或去活化型病毒檢體運送裝置輔助各種病原的檢測。

 

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