臨床微生物診斷學作微生物檢查的糞便，由病人排出後，可直接裝入一無菌的塑膠容器內。一般而言，糞便中含有黏液（mucus）的部分，最適合作微生物檢查。

欲採集直腸檢體時，須以肥皂、水和 70% 酒精將肛門周圍洗淨，然後用一根浸過無菌生理食鹽水或液體攜送培養基之拭子插入肛門，輕輕旋轉，使其與直腸黏膜之表層接觸，然後取出置於CultureSwab/Aerobic Transcultswab（嗜氧攜送培養基）（針對沙門氏菌）之攜送裝置或buffered glycerol saline（緩衝甘油生理食鹽水）（針對志賀氏菌）攜送培養基之容器，並立即送至檢驗室。有時糞便檢體亦可從直腸指診（digital examination）時所用的手套取得。

如糞便檢體欲作寄生蟲檢查時，應將裝於無菌 塑膠容器之檢體迅速送至檢驗室，使檢驗人員能立即檢查仍溫熱的糞便。此點必須要特別注意，因糞便中有些寄生蟲如阿米巴（amoebas），在糞便排出冷卻 後，會迅速失去其運動性。如預料無法立即作檢查時，可將裝檢體的容器置於 37℃ 左右之水槽中，才能維持相當時間的溫熱。

糞便或直腸拭子檢體作微生物檢查時，要特別注重攜送與接種的迅速性，如有拖延，可能一些非病原性腸桿菌之生長速度會超過病原菌，而使病原菌之分離發生困難。

文章擷取：實用臨床微生物診斷學（蔡文城博士 編著）

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